En Taro Adun ! Depuis des mois, les Protoss tentent d'arrêter les Zergs en brûlant systématiquement les planètes Terranes infestées. Mais l'Éxécuteur Tassadar a voulu protéger les Terrans tout en menant à bien sa mission. Par sa faute, cette abomination d'Overmind s'est implanté sous la surface d'Aïur et ils doivent désormais faire face à l'invasion de l'Essaim tout entier. C'est au Judicateur Aldaris et au Prêteur Fenix que le Conclave confie la tâche de renforcer les défenses Protoss dans la province d'Antioch.
La paisible Aïur est menacée par l'invasion Zerg
Depuis Char, Tassadar se met rapidement en contact avec eux pour leur faire de consternantes révélations. Après la destruction de Tarsonis, il s'est rendu sur la planète volcanique, attiré par un puissant appel psionique. Là il rencontra ceux qui furent rejetés par le Conclave bien des siècles plus tôt, les Templiers Noirs, dont le Prélat Zeratul lui apprit le fonctionnement des Cerebrates.
Suivant le conseil de Tassadar, Aldaris et Fenix décident d'assassiner un Cerebrate dans la zone d'influence Zerg. Las, la créature renaît devant leurs yeux peu de temps après. Aldaris décide donc de lancer un assaut plus standard contre les Zergs dans la province de Scion. Au même moment, d'importantes légions Zergs attaquent Fenix et ses guerriers restés à Antioch. Le Prêteur tombe au combat. C'est une lourde perte pour le Conclave mais la Ruche de Scion ayant été détruite, les Protoss pensent que la guerre contre les Zergs sera bientôt gagnée. Ils recentrent donc leur attention sur des affaires moins urgentes dont la désertion de Tassadar.
Tassadar est poursuivi pour haute trahison par Aldaris et le Conclave
Convaincu que l'influence des Déchus a mené ce dernier à la folie, Aldaris se rend sur Char pour l'arrêter et le ramener sur Aïur afin qu'il y subisse la loi de la Khala, principale religion Protoss. Il trouve Tassadar flanqué d'un humain, Jim Raynor, qu'il a rencontré ici-même sur Char. Décidément le Templier choisit de biens étranges compagnons. Jamais le Conclave n'aurait pensé que Tassadar, le plus vaillant de tous les guerriers Protoss, celui en qui ils fondaient tant d'espoirs, leur faillirait à ce point.
Mais par fidélité à la caste des Templiers, l'Éxécuteur Artanis, qui accompagne Aldaris, décide d'aider Tassadar au lieu de l'arrêter. Ensemble, ce contingent mi-Protoss mi-Terran se met aussitôt à la recherche de Zeratul. Ils savent désormais avec certitude que seule l'énergie profane des Templiers Noirs peut détruire les Cerebrates et donc fragiliser l'Overmind ; c'est pourquoi l'attaque d'Aldaris et Fenix avait échoué. Il faut donc ramener au plus vite Zeratul et les siens sur Aïur pour sauver ce qui peut encore l'être. Tassadar parvient à libérer les Templiers Noirs qui avaient été faits prisonniers par Kerrigan dans une installation Terrane sur Char.
Tassadar, Zeratul, et Jim Raynor rentrent sur Aïur
De retour sur Aïur, c'est avec stupéfaction que Tassadar et Zeratul voient venir le Prêteur Fenix vers eux. Après la bataille d'Antioch, son esprit a pu être sauvé et il est réincarné dans le corps d'un Dragoon. Tassadar se sait poursuivi par le Conclave. S'il veut avoir une chance de détruire les Zergs et sauver les Protoss, il doit se résoudre à l'attaquer. Mais au moment où ses alliés sont prêts à vaincre le Conclave, il ne peut supporter de voir ses frères s'entre-tuer et se livre donc à Aldaris.
Fenix, aidé de Raynor, se porte rapidement au secours de Tassadar et le libère de la cellule de Stase dans laquelle il était retenu en attendant son jugement. Zeratul apprend alors à Fenix tout ce qu'il sait : lors de leur contact psychique, Zeratul a pu voir les pensées de l'Overmind. Ainsi, les Zergs ont eux aussi été créés par les Xel'Naga, chose que les Protoss ignoraient. Il a également pu voir le dessein funeste du Maître-Esprit.
Zeratul a pu pénétrer l'esprit de l'Overmind
L'heure est enfin venue d'attaquer la Ruche principale de l'Overmind sur Aïur. Les Templiers Noirs tuent deux Cerebrates, affaiblissant ainsi les défenses Zergs. Le Judicateur Aldaris et le Conclave, témoins de cette première victoire, se rendent compte qu'ils ont mal jugé Tassadar et Zeratul. C'est avec leur consentement et le peuple Protoss enfin uni que l'assaut final est porté.
L'enveloppe externe de l'Overmind est détruite mais cela ne suffit pas à tuer le puissant Maître-Esprit. Tassadar décide alors de canaliser ensemble les énergies des Templiers Noirs, le Vide, et l'énergie mère, la Khala, avant de jeter son vaisseau sur l'Overmind et l'anéantir à tout jamais. Le sacrifice de Tassadar va-t'il enfin permettre au peuple Protoss de retrouver la paix ?
Tassadar canalise les énergies du Vide et de la Khala pour détruire l'Overmind