Mémoires oubliées
Jiminy Cricket, qui suivait Sora pendant ses aventures, avait tenu deux journaux distincts de tout ce qui s'était passé. Il découvrit que l'un des deux était vide. Il ne restait juste qu'une phrase : "Remercier Naminé", qu'il avait écrite lui-même pendant les épreuves dans le Manoir Oblivion, sachant qu'il n'allait plus se souvenir d'elle. En tournant les pages de ses journaux, il se rendit compte qu'une deuxième page comportait une inscription qu'il n'avait, cette fois, pas écrite : "Leurs tourments s'apaiseront lorsque vous reviendrez".
Le roi Mickey, souhaitant percer ce mystère, numérisa les deux journaux de Jiminy, mais des bugs l'empêchèrent de retrouver les données. Il décida alors d'envoyer une version numérique de Sora, Data-Sora, afin de revivre les événements du journal. Au cours de son aventure, Sora croisa la route d'un homme portant un manteau noir avec une capuche qui l'aida à plusieurs reprises, ce dernier se révéla être Riku, ou plus précisément, Data-Riku. Ce dernier se révéla être un amas de données des journaux, il était l'incarnation des journaux de Jiminy Cricket.
Après avoir débarrassé les mondes des bugs les infestant et alors que la restauration des données était presque achevée, Data-Sora et Data-Riku se confrontèrent à un sans-coeur particulièrement puissant qui s'était renforcé avec chaque sans-coeur que Sora avait réussit à vaincre : c'était l'ombre de Sora. Suite à cette victoire, le journal de Jiminy fut réinitialisé et toutes les données restaurées. Seule la partition concernant Data-Riku resta intacte, il ne perdit donc pas la mémoire.
Data-Sora rencontra un membre de l'Organisation XIII qui se révéla être Data-Roxas, qui était un inconnu pour ce dernier. Il l'aida à comprendre le véritable sens de la douleur. Suite à cela, Data-Sora rencontra Data-Naminé qui lui révéla qu'elle était à l'origine du message dans le journal de Jiminy et que le véritable Sora était la clé de tout. La jeune fille lui dit qu'en raison de ses liens avec Roxas, Axel, Xion, Naminé, Terra, Aqua et Ventus, qui sont en relation avec le coeur de Sora, il se devait de les sauver de leurs blessures mais que les souvenirs de ces personnes, mal gérés, pourraient conduire à la destruction du coeur de Sora.
Pendant ce temps, Mickey partit retrouver son ancien maître, Yen Sid, qui tentait de trouver une solution pour retrouver les trois anciens élèves d'Eraqus. Le roi expliqua qu'il était sur une piste pour trouver le coeur de Ventus et qu'Aqua se trouvait dans le Monde des Ténèbres. Il ne restait plus qu'à trouver Terra. Yen Sid avoua que depuis que le sans-coeur ainsi que le simili de Xehanort avaient été détruis, son coeur et son corps pouvaient à nouveau fusionner afin que Maître Xehanort reviennent à la vie.
Ce dernier étant une menace trop importante pour un seul Maître de la Keyblade, Yen Sid ordonna à Mickey de convoquer Sora et Riku afin qu'ils passent tous les deux l'examen du symbole de maîtrise afin qu'ils deviennent eux aussi des Maîtres de la Keyblade. Le roi se précipita pour écrire une lettre aux deux amis qu'ils recevront sur la plage de l'Île du Destin, amenée par Kairi.
Aqua, de son côté, toujours enfermée dans le royaume des Ténèbres, y rencontra Ansem le Sage, lui aussi bloqué dans ce monde après l'explosion de sa machine. Il raconta à Aqua qu'il avait rencontré un garçon ayant sauvé le monde à deux reprises et caché ses recherches à l'intérieur de celui-ci, espérant qu'au moment venu, il utiliserait ces connaissances pour sauver toutes les personnes qui sont liées à son coeur.
