La saison 3 débute sur les chapeaux de roue pour les Fnatic puisqu'ils arrivent à se qualifier pour les LCS en sortant 2e de leur groupe et en battant les MeetYourMakers lors du bracket qualificatif sur un score de 2-0.
Une fois dans le vif de la compétition, Fnatic réalise un superbe premier split puisque l'équipe termine la saison régulière à la première place sur un score de 22-6. Ils se retrouvent donc directement qualifiés pour les demie-finales des playoffs face aux Evil Geniuses qu'ils battent assez facilement. La formation finit par remporter la finale face aux Gambit Gaming, de justesse certes, avec un score de 3 à 2.
Entre le split de printemps et d'été, Fnatic participe au Championnat du monde des IEM. L'équipe ne fera pas une très grande prestation lors du Championnat du monde des IEM. Ils sont éliminés dès les phases de groupe en finissant 5e sur un score de 1-4, ne gagnant que face aux paiN Gaming, le petit poucet du groupe. Les joueurs semblent retomber dans une période noire, et disent au revoir à leur bonne performance du spring split.
Au début du summer split, la botlane formée par YellOwStaR et nRated ne semble pas fonctionner et la structure décide de se détacher des services de nRated après trois semaines de Summer Split et de recruter un nouveau Carry AD vu que YellOwStaR jouera désormais en support. Ils embauchent donc Johannes « puszu » Uibos afin d'essayer de se qualifier pour les Championnats du monde de la saison 3. Cette nouvelle botlane mettra du temps à trouver ses marques, mais monte rapidement en puissance. L'équipe finit la saison régulière des LCS EU Summer Split en seconde place sur un score de 15-13, derrière les promus de Lemondogs (18-10). L'équipe Fnatic est cependant à égalité avec 3 autres formations eux aussi à 15-13, les Evil Geniuses, Gambit Gaming et Ninjas in Pyjamas. Se jouera donc un tiebreaker afin de décider du qualifié direct pour les demi-finales des playoffs. Les Fnatic l'emportent facilement sur un score de 2-0 et gagnent ainsi leur billet pour les demi-finales.
Malgré une saison régulière cahin-caha, les playoffs sourient aux Fnatic. Ils réussissent à battre les Evil Geniuses en demi-finales sur un score de 2-0 puis les Lemondogs lors de la finale sur un score de 3-1. Les Fnatic finissent donc premiers en Europe et sont qualifiés pour les Championnats du monde de la saison 3.
La phase de groupe est une franche réussite pour l'équipe puisqu'elle sort première de son groupe sur un score de 7-1. Ils auront eu tout de même de grosses oppositions puisque le groupe B comptait les Gambit, les Samsung Ozon, les Vulcun et la modeste équipe des Mineski. Ils remportent avec brio tous leurs matchs en ne concédant qu'une seule manche à Vulcun et se qualifient pour la suite de la compétition : les quarts de finale.
Le quart de finale entre Cloud 9 et Fnatic sera un match très symbolique puisqu'il décidera de quel continent occidental est le meilleur sur League of Legends. Les Fnatic sortent un superbe match, ils remportent la première manche, s'inclinent lors de la deuxième puis imposent leur jeu lors du troisième round, en ne laissant aucune chance à l'équipe américaine. Cette dernière manche restera dans les mémoires et aura été un moment fort dans l'histoire de League of Legends.
La structure se retrouve donc opposée aux Royal Club en demi-finale. L'équipe européenne s'incline contre les Chinois lors des 2 premières manches, mais arrive à créer la surprise en leur prenant la 3e, après une démonstration de jeu d'équipe exceptionnelle. Malheureusement les Royal Club, ne se laissent pas démonter et malgré une superbe 4e manche de part et d'autre, ils accèdent à la finale des Championnats du monde de la saison 3.
Malgré une saison 3 en dents de scie, résultant surement des multiples changements de roster effectués par la structure, Fnatic aura tout de même fini premier des LCS Europe. De plus, pour couronner le tout, les joueurs auront réussi une très belle performance durant les Championnats du monde et auront montré au monde qu'ils demeurent dans le top de la scène de League of Legends.